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新开放式数据库帮助抗击发展中国家传染病物流

发布时间:2019-11-29 18:15:04 阅读: 来源:扭扭车厂家

科学网-新开放式数据库帮助抗击发展中国家传染病

一个国际研究人员网络4月16日宣布准许公开一个新的以网络为基础的资源,预计促进药物开发,以抗击殃及发展中世界的传染病。确定药物靶点优先顺序数据库可在http://TDRtargets.org检索。 这是第一次由任何团体为一系列如此不同的寄生虫和细菌性疾病汇编与药物靶点发现有关的一批如此广泛的信息, 来自西雅图华盛顿大学的Wesley Van Voorhis博士说,他协调设在世界卫生组织(世卫组织)的热带病研究和培训特别规划于2005年建立的确定药物靶点优先顺序网络。该联盟包括一个全球学术实验室、研究中心和工业科学家小组,注重于造成疟疾、结核、非洲昏睡病、利什曼病、恰加斯病以及血吸虫病和丝虫病等寄生虫感染的病原体 所有这些急需新的治疗药物。这些疾病合起来每年造成发展中世界数十亿感染和600多万人死亡。由于贫穷国家通常没有资金或基础设施支持卫生研究和药物开发,类似这样的新的合作正在努力改善这种状况,提供资源将世界各地的科学家汇集在一起。为药物发现开辟新途径该网络的目标是针对主要影响发展中国家的疾病查明药物靶点并确定其优先顺序。该数据库是独特的,它使发达国家和发展中国家的任何研究人员能检索这类信息。来自阿根廷的网络成员、负责设计大部分数据库体系结构的Fernan Aguero博士说, 我对这一资源将为药物发现开辟新途径产生的影响感到十分兴奋。通过这项合作努力,我们有机会为世界各地我们的公民和其它人开发新的治疗药物。 该网络 提供了一个杰出的例子,显示世卫组织如何能汇集多个团体制定联合解决方案, 热带病研究和培训特别规划主任Robert Ridley博士说。 我们帮助召集适当的个人和在需要的国家内开发技术专长,影响全球研究资源以开发新的治疗药物。 该数据库基于十年强化国际投资,这些投资已导致为造成五种热带病的微生物确定完整基因组序列,并且预期为称为蠕虫的寄生虫确定更多基因组序列。制药公司拥有可对致病病原体起作用的广泛化学品库。本项行动采取的缺失措施是除使用户能确定其自己的搜索条件之外,提供一份建议并经验证的药物靶点目录。主要负责数据库设计的宾夕法尼亚大学基因组学研究所David Roos博士说, 这个网站使研究人员能通过确定适合于其特定规划能力的标准确定药物靶点的优先顺序。例如,在一类药物靶点的研究方面杰出的一个大学实验室可查明看来最有希望作为药物靶点的那些酶,而一个制药公司可选择适合其特定药物化合物采集标本的候选化合物或研发分析方面的技术专长。 经验证的药物靶点广泛目录在世卫组织/热带病研究和培训特别规划领导药物发现活动的Solomon Nwaka博士说,这一资源应能加速耗时和高风险的药物开发早期阶段。 人们日益认识到需要为这些疾病找到新的治疗靶点。制药公司对于针对寄生虫靶点筛查其化学品数据库越来越感兴趣,但是尚不能容易地获得这些微生物经检证的药物靶点广泛目录。这一项目的本意是为每一病原体制定一个经验证靶点 前十位目录 ,但是很快变得明显的是,使研究人员能个性化定制标准在数据库中选择靶点将提供更多好处,包括持续更新数据库的灵活性。 TDRtargets.org网站把每一个重点微生物的现有基因组和生物信息学数据与从每一个推定药物靶点相关的研究文献和其它数据库中自动摘录和手工辅助提取的信息结合在一起。该网络已在注释方面投入大量努力以便协助科学家查明高价值的药物靶点。该数据库还允许现场专家发表评论。用户确定的加权允许按照其可取性对潜在药物靶点进行排列,提供确定优先顺序的个性化目录。虽然开发这一网络的目的是促进确定药物靶点,但是它极有可能对确定疫苗靶点和诊断靶点也是有用的,并且可以激励对靶点验证、研发分析、生物标记和耐药性开展基础研究。该网络包括来自圣马丁将军国立大学(阿根廷)、桑格研究院(英国)、墨尔本大学(澳大利亚)、宾夕法尼亚大学基因组学研究所(美国)以及西雅图华盛顿大学(美国)的调研人员。辉瑞、Inpharmatica公司、旧金山加利福尼亚大学和New England Biolabs提供了与靶点结构、本质和成药性有关的实物支持和信息。该数据库还利用全世界基因组排序中心和其它研究人员公开提供的全基因组规模数据集。该数据库可在http://TDRtargets.org检索,并且该网络鼓励国际社会利用这一资源,贡献补充数据,并提出进一步改进的建议。

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